剑桥大学圣约翰学院是剑桥大学第二大学院，在学生人数上仅次于三一学院，学院的创办人是王太后玛格丽特·博福特（Margaret Beaufort）女士。学院原来是13世纪时修建的剑桥圣约翰医院，到16世纪初时医院已经破旧不堪。罗彻斯特主教约翰·费舍尔（John Fisher）于是向亨利七世的母亲、剑桥大学基督学院的创办人玛格丽特·博福特女士建议在医院的原址上兴建一所新的学院，获得其允诺。1509年博福特在学院的蓝图还未规划好之前就去世了，费舍尔之后又花了2年时间才取得国王和大主教对学院的支持，并最终于1511年4月9日创办了这所圣约翰学院。
国王学院国王学院（King‘s College）是剑桥大学内最有名的学院之一，成立于1441年，由当时的英国国王亨利六世设立创建，因而得名“国王”学院。 最初创立时只有1名院长和70名学生，全部来自伊顿公学。当时国王学院是专门为亨利六世所创的伊顿公学的毕业生而建立的，不收其他学生。 为了显示国王的雄厚财力，学院建立之初就追求宏伟壮观的建筑，而其建筑群中最著名的当属国王学院礼拜堂，它耸入云霄的尖塔和恢弘的哥特建筑风格已经成为整个剑桥市的标志和荣耀。
彼得学院剑桥大学彼得学院（英语：Peterhouse, Cambridge)始建于1284年，是剑桥大学建立最早的学院。彼得学院现有284名本科生，130名研究生和45名院士，是剑桥大学最小的学院。 彼得学院是剑桥大学第一个安装电灯的学院，由威廉·汤姆森在1883至1884年为学院的会堂和公共休息室安装电灯，用来庆祝学院600周年纪念。 在19世纪80年代，彼得学院和英国保守党有着密切的联系，莫里斯·康宁和罗杰·顿都是学院当时有影响的院士 ，保守党的政客迈克尔·波蒂洛和迈克尔·霍华德也都曾经就读于彼得学院。在这段时期，彼得学院研究员内部也存在着大量的政治冲突。
女王学院剑桥大学女王学院坐落在国王学院南侧，学院由1448年亨利六世的女王玛格丽特和1465年爱德华四世的王后伍德维尔共同捐资建立，所以学院名称中的“Queens'”指代的就是这两位女王。 女王学院横跨剑河而立，由举世闻名的“数学桥”相连接，剑河西畔的女王花园花红柳绿，青翠满园，是剑桥最优美的风景之一。 女王学院内的其他主要景观还有：以16世纪中期木造校园回廊为代表的都铎式中庭、建于15世纪的伊拉斯谟斯塔和旧礼拜堂（Old Hall）等。著名的文艺复兴时期的神学家和思想家伊拉斯谟和著名诗人怀特即是女王学院校友。